致病性病原微生物数据分析平台

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介绍

致病性病原微生物数据分析平台,主要内容涵盖相关的基因组和蛋白组数据分析。


基因组分析

1. Blastn against gene

2. Blastn against genome

3. OrthoMcl(同源基因分析)

4. 共线性分析(变异检测)

5. 系统发育树(SNP)

6. CRISPR分析

7. VFDB注释(毒力因子)

8. ARDB注释(抗性/耐药)

9. Cazy注释(碳水化合物相关酶)

10. PHI注释(病原与宿主互作)

11. TCDB注释(转运蛋白分类)

12. GO/KEGG功能注释


统计

  • 细菌基因组数目:16

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参数

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