致病性病原微生物数据分析平台
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基因组分析
Blastn against gene
Blastn against genome
OrthoMcl(同源基因分析)
共线性分析(变异检测)
系统发育树(SNP)
CRISPR分析
VFDB注释(毒力因子)
ARDB注释(抗性/耐药)
Cazy注释(碳水化合物相关酶)
PHI注释(病原与宿主互作)
TCDB注释(转运蛋白分类)
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介绍
致病性病原微生物数据分析平台,主要内容涵盖相关的基因组和蛋白组数据分析。
基因组分析
1. Blastn against gene
2. Blastn against genome
3. OrthoMcl(同源基因分析)
4. 共线性分析(变异检测)
5. 系统发育树(SNP)
6. CRISPR分析
7. VFDB注释(毒力因子)
8. ARDB注释(抗性/耐药)
9. Cazy注释(碳水化合物相关酶)
10. PHI注释(病原与宿主互作)
11. TCDB注释(转运蛋白分类)
12. GO/KEGG功能注释
统计
细菌基因组数目:
16